在PSM上出现的杂草基因组

PSM的Eric Patterson博士与MSU、科罗拉多州立大学的同事以及行业合作伙伴一起启动了国际杂草基因组学联盟,这是一个对多达30种常见杂草物种进行测序、注释和发布基因组的项目。

农民、科学家甚至后院园丁很快就能看到最新公布的最常见农业杂草的基因组。通过合作的专业知识,创造性的资金,以及对可持续农业研究的热情,PSM的bob体育合法吗bob体育登录埃里克·帕特森博士他在科罗拉多州立大学(Colorado State University)的同事,以及行业合作伙伴已经启动了国际杂草基因组学联盟(International Weed Genomics Consortium),该计划对多达30种常见杂草进行基因组测序、注释和发表。在这个为期三年的项目的第一年,帕特森成为了研究助理bob体育登录内森·霍尔博士说他们的进展超出了预期。

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研究生Juilano Sulzback在Michigan horweed (Conyza黄花作为IWGC项目的一部分。

与行业合作伙伴一起国际杂草基因组学联盟就是收获、种植和储存植物组织,然后对杂草基因组进行测序和组装。在帕特森的实验室里,霍尔注释了基因组并赋予它们功能。

霍尔说:“我们将它们转换成可发布的格式,并维护一个门户网站,这样农民和推广专家就可以查看、下载和使用这些信息。”

从工业界的资助开始,IWGC能够通过与食品与农业研究基金会(FFAR)bob体育合法吗bob体育登录这是美国bob体育登录农业部成立的一个研究和资助机构。

帕特森说:“最初的目标是每年对10种杂草进行测序,选择它们是因为它们对行作作物的危害最大。”“FFAR的匹配资金使我们能够对常见的草坪、范围和水生杂草进行基因组分析,所以现在我们正在研究10种行作物杂草和10种非行作物杂草,并一直扩展到更新颖的基因组。”

额外的资金还提供了两个夏季NSF在MSU植物基因组学的reu,一个Python编程的培训课程,以及一个会议国际杂草联盟

帕特森说:“我们在质量和速度上都超出了预期。”“我们已经完成了几个染色体水平的多倍体基因组,并希望很快发布它们。”

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埃里克·帕特森博士(左)和内森·霍尔博士正在研究地肤,作为IWGC项目的一部分,他们最近对其进行了测序和注释。

霍尔还说,他觉得自己真的在为科学做出贡献。“这是人们第一次想要确切地了解他们的田地里发生了什么,他们将有这种超级容易使用的信息用于他们的植物保护计划。”

帕特森说,在农场和花园之外,这些资源的扩散正在帮助我们回答关于适应和大科学的问题。“一旦你知道了抗性基因的基因,你就走上了一条更精确、更可持续、更科学的农业道路。bob体育合法吗有了这些信息,我可以告诉农民‘你的田地里有抗药性’,并帮助他们重新关注他们的植物保护计划。”

阅读更多关于这个项目在FFAR网站

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