农业与自然资源学院bob体育下载iosbob体育合法吗植物、土壤和微生物科学系“，

• Lenski的实验室网站
• 理查德·伦斯基的出版物谷歌学者．

bob体育登录主要研究方向:

主要焦点

我实验室的主要研究方向是实验进化．进化论通常用比较法或通过研究化石来研究。我们的方法是在实验的背景下，在受控条件下复制和执行，观察进化的发生。观察进化过程的想法并不新鲜。事实上，查尔斯·达尔文，在第一版的《论物种起源(1859，第187页)说:“在寻找任何物种的器官已经完善的层次时，我们应该专门关注它的直系祖先;但这几乎是不可能的，在每一种情况下，我们都被迫寻找同一群体的物种，也就是说，来自同一原始父母形式的附属后代。”

为了研究进化过程，我们需要一台时间机器(我们没有)或者其他方法快速复制、变异和进化的生物，以便我们能在合理的时间范围内侦测变化。在我们的研究中bob体育登录，我们正在用两个不同的快速进化系统进行实验:

• 细菌,主要是大肠杆菌；而且
• 数字有机体在创造系统．

在这两个系统中，我们都在研究进化的动力,包括基因组还有表型的变化。我们的目标是通过识别和操纵生物体性能和适应性的遗传和生态决定因素来整合我们对这些基因组和表型变化的理解。我们用来绘制这些联系的方法范围很广，从寻找感兴趣的特定突变到分析总结整个基因组与其编码的所有表型之间关系的阵列。通过使用两个完全不同的系统，我们可以寻找可能表明演化系统的更普遍特征的共性。同样有趣的是，这些系统之间的主要差异可能会引导我们进行进一步的实验，以探索特定结果的原因。

长期进化实验

在一个长期进化实验大肠杆菌我们从同一个祖先中建立了12个复制种群，这些种群在相同的环境中进化了3万多代。我们进行了竞争实验，以量化生物体适应性的变化，分析全基因组表达阵列，以发现编码全局调控因子的基因中的有益突变，并测量自发突变率，以发现dna修复功能的变化，以及许多其他方法和发现。即使经过十多年的研究，我们仍然在这些不断进化的种群中发现了令人着迷的进化变化。

数字工作

我的工作数字有机体开始于几年前，当我开始与阿达米克里斯(加州理工学院),查尔斯Ofria(现在在密歇根州立大学)使用他们的Avida软件进行实验。数字生物是在它们所生活的计算世界中自我复制、变异、竞争、适应和进化的计算机程序。阿维达系统建立在高山气候带它是由ALife先锋公司开发的汤姆雷，有许多不同之处和扩展。Avida的一个关键特征是，数字生物不仅可以进化成更快的复制者，而且可以通过执行逻辑功能来获得更多加速复制的资源。除了寻找细菌进化的共性和差异之外，阿维达还能让我们进行更深入的探索，即使是像这样宏伟的生命系统大肠杆菌．例如，我们最近发表在自然一项研究表明从头起源的A复杂的机体功能在这个过程中，我们可以追踪导致该功能出现的数十个突变中的每一个。此外，我们可以看到这些突变是如何影响数字生物的所有其他表型特性的。我们可以在许多不同的选择环境中对数十个复制种群进行这样的实验。

细菌、病毒和质粒

在目前和过去的其他项目中，我们使用细菌以及感染它们的病毒和质粒来研究:

• 冲突与合作社会的细菌
• 适应环境变量
• 形式及范围突变之间的相互作用
• 进化和控制变异率
• 生态与进化开始交往
• 的进化抗生素耐药性

出版物:

1. 洛索斯，J. D.鲍姆，D. Futuyma, H. Hoekstra, R. E. Lenski, A. J. Moore, K. Peichel, D. Schluter和M. Whitlock编著。2013.普林斯顿进化指南．普林斯顿大学出版社，普林斯顿，正在印刷中。(小狗)
2. Lenski, R. E. 2013。进化与现代社会。在J. Losos, D. Baum, D. Futuyma, H. Hoekstra, R. E. Lenski, A. J. Moore, K. Peichel, D. Schluter, M. Whitlock主编。普林斯顿进化指南．普林斯顿大学出版社，普林斯顿，正在印刷中。(小狗)
3. A. W. III . Covert, R. E. Lenski, C. O. Wilke, C. Ofria, 2013。关于有害突变在适应性进化中作为垫脚石作用的实验。美国国家科学院学报，出版中。
4. 韦尔戈斯，S. J. E.巴里克，O. Tenaillon, M. J. Wiser, W. J. Dittmar, S. Cruveiller, B. chane - woming, C. Médigue, R. E. Lenski, D. Schneider. 2013。细菌种群的突变率动态反映了适应和遗传负荷之间的紧张关系。美国国家科学院学报110: 222 - 227。(抽象)
5. 卡维克，T. J.， R. E.伦斯基，D.伊伯特，B.霍利斯，I.奥利维耶里，M. C.惠特洛克。2012。进化研究中互补方法的价值:回复Magalhães和Matos。bob体育登录《生态学与进化趋势》27: 650 - 651。(链接)
6. 布朗特，J. E.巴里克，C. J.戴维森，R. E.伦斯基，2012。基因组分析是实验中的一项关键创新大肠杆菌人口。自然489: 513 - 518。(抽象)
7. 卡维克，T. J.， R. E.伦斯基，D.伊伯特，B.霍利斯，I.奥利维耶里，M. C.惠特洛克。2012。进化实验。《生态学与进化趋势》27: 547 - 560。(抽象)
8. 克伦，J.， R. T.彭诺克，C.奥弗里亚，R. E.伦斯基，2012。个体发生倾向于再现数字生物的系统发育。美国博物学家180: E54-E63。(抽象)
9. 扎曼，L.， C.奥弗里亚，R. E.伦斯基，2012。指画健身景观:探索复杂进化动力学的互动工具。第499-505页第十三届生命系统模拟与综合国际会议．(抽象)
10. 勒Gac, M. J.普拉因，T. Hindré， R. E. Lenski, D. Schneider, 2012。共存世系的生态和进化动态大肠杆菌．美国国家科学院学报109: 9487 - 9492。(抽象)
11. 莫里斯，j.j.， R. E.伦斯基，E. R.津瑟，2012。黑皇后假说:通过适应性基因损失的依赖进化。mBio3.: e00036-12。(抽象)
12. 梅耶，J. R.多拜厄斯，J. S.韦茨，J. E.巴里克，R. T.奎克，R. E.伦斯基，2012。噬菌体Lambda关键创新进化的可重复性和偶然性。科学335: 428 - 432。(抽象)
13. 伦斯基，r.e 2011。细菌病原体进化的机会和必要性(新闻和观点)。自然遗传学43: 1174 - 1176。(链接)
14. 韦尔戈斯，J. E.巴里克，O.特奈永，S.克鲁维利耶，B.钱云明，C. Médigue, R. E.伦斯基，D.施耐德。2011。在长期进化实验中从同义替换推断突变率大肠杆菌．G3:基因，基因组，遗传学1: 183 - 186。(抽象)
15. 哈格，E. S.和R. E.伦斯基，2011。殷范提可怕的30岁:进化发育生物学的成熟(会议回顾)。发展138: 2633 - 2637。(抽象)
16. 汗，D. M.丁，D.施耐德，R. E.伦斯基，T. F.库珀，2011。进化中的细菌种群中有益突变之间的负上位性。科学332: 1193 - 1196。(抽象)