841年荷尔蒙替代疗法:在计算和植物科学基础
课程代码:841年荷尔蒙替代疗法
学分:3
贷款和发行
- 每周3学分(约3个小时的讲座)
- 每年秋季学期
- 对各部门的学生开放
课程描述
计算模型应用于植物生物学。数据分析,算法思想,使用编码模型构建、生物信息学、分子生物学和计算资源。
课程目标
本课程假设学生以前没有在植物生物学或编码经验;相反,本课程选择具体的例子中,数学,建模和生物与植物的生物学相交。学生学习目标应用于课程研究项目。bob体育登录
课程材料
课程材料可以在网上找到https://github.com/DanChitwood/PlantsAndPython
主题
- 使用Jupyter教育笔记、编码和研究bob体育登录
- 从头开始编码:索引、循环、字典、功能
- 数据可视化
- 使用数学和代码模型生物现象
- 使用高性能计算(HPC)资源
- 使用Biopython阅读、存储、写作、和操作序列
- 比较基因组学
- 短阅读分析
- 将学到的概念应用到学生研究问题bob体育登录
- 研究和科学写作交流bob体育登录
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