农业和自然资源学院bob体育下载iosbob体育合法吗植物、土壤和微生物科学

• bob体育登录主要研究方向:

我们实验室研究的生态学和演化plant-fungal-bacterial协会,与特定兴趣相关的地下的根真菌包括松露、蘑菇和模具。这些生物提供重要的植物和土壤之间的联系,并在功能上是重要的植物健康和营养以及通过陆地生态系统养分循环和能量的流动。

我们的系bob体育登录统发生学的研究利用,高通量测序,同位素示踪剂和组学方法来更好的理解:

1. 系统发育和功能root-associated真菌的多样性。
2. 环境和遗传因素根微生物群落结构。
3. 细菌的进化和功能相关性的真菌共生体。

我们实验室的研究bob体育登录应用程序相关的农业、林业、地球生命支持系统的可持续性。bob体育合法吗

一般的专长领域:

真菌学,plant-fungal交互,松露生态学、进化的细菌内共生真菌;真菌分类学;松露生物学;plant-fungal-bacterial交互。

教学

PLP 847 /拉钮847 / MMG 847 -先进的真菌学
2022年秋季

课程描述,先进真菌学four-credit讲座和实验室课程提供研究生和本科生与当前先进的研究和技术在真菌生物学、生态学、进化和基因组学。bob体育登录在课堂上的部分,学生将重新审视基本文学真菌学,会导致学术讨论和礼物。实验室将包括古典和现代实验室技术在真菌学,和研究利用高通量测序技术,生物信息学计算解决学生研究问题和生态统计。bob体育登录

出版物

• 格里高利·鲣鱼的出版物谷歌学术搜索。

同行评议的出版物

1. 希利RA,霍纳HT,鲣鱼G史密斯,麦克劳克林DJ,我。2017年。孢子壁的超微结构的研究开发和隔膜孔的物种Pachyphlodes(盘菌目Pezizaceae)血统,新物种的描述Pachyphlodes annagardnerae。真菌学的进展。doi.org/10.1007/s11557 - 017 - 1348 - 3。
2. Desiro, Rimington W,雅各,Vande波尔N,史密斯M, Trappe J, Bidartondo M,鲣鱼G。2017年。Endogonales,多基因种系发生的早期不同血统的真菌与植物有关。IMA的真菌。
3. Hejase H, VandePol N,鲣鱼G刘,磨边机P k . 2017。煤炭企业:GWA研究统计方法定量特征的复杂的进化起源。ISMB
4. 通用电气ZW, Brenneman T,鲣鱼G史密斯,我。2017年。土壤pH值和矿物营养强烈影响块菌和其他真菌真菌与商业山核桃(Carya illinoinensis)。植物和土壤。DOI 10.1007 / s11104 - 017 - 3312 - z
5. 布林斯力Torres-Cruz T,托拜厄斯TL, Almatruk M,黑森州CN, Kuske CR、Desiro D, Benucci GMN,鲣鱼G丹拉普,Stajich J, C,阿诺AE, Porras-Alfaro a . 2017。Bifiguratus adelaidae将军等sp. 11月,一个新的血统的Mucoromycotina植物和土壤中菌株。Mycologia。
6. Fechner N,鲣鱼G大树枝NL,叔叔是T,哈林舞》2017。新物种的Austroboletus(牛肝菌科)在澳大利亚。真菌学的进展。
7. Uehling J,Gryganskyi, Hameed K, Tschaplinski T, Misztal PK,吴年代,Desiro, Vande波尔N, Du Z, Zienkiewicz, Zienkiewicz K,莫林E, Tisserant E, Splivallo R,埃诺M, Henrissat B,欧姆R,郭,燕J, Lipzen,诺兰M, LaButti K,巴里·K戈尔茨坦啊,拉贝风J,斯凯特C, Tuskan G,眼镜,马丁F, Vilgalys R,鲣鱼G。2017年。基因组测序揭示了一个独特的细菌内共生起源最早的血统陆地真菌。环境微生物学。
8. 鲣鱼G,Hameed K, Toome-Heller M,希利R,里德C,廖霍奇金淋巴瘤,艾梅MC,斯凯特CW, Vilgalys R . 2017。Atractiella rhizophila,小说endorrhizal真菌在锈血统(Puccinomycotina)适应的根微生物杨树和一个广泛的多样性的植物。真菌学。
9. 维JM, Tschaplinski TJ Vilgalys R,斯凯特连续波,鲣鱼G汉密尔顿、Hameed K、c . 2017。描述的小说,无处不在的真菌内生植物根际和根endosphere的杨树。真菌生态学。
10. Marozzi G,桑切斯,Benucci GMN,鲣鱼G, Falini磅,阿尔贝蒂尼E, Donnini d . 2017。Mycorrhization山核桃(Carya illinoinensis与黑松露):块茎brumale和即。菌根。
11. Spatafora JW, Chang Y, Benny GL,拉撒路K,史密斯我,Berbee毫升,鲣鱼G,使得科拉迪N,眼镜,Gryganskyi,詹姆斯•泰O ' donnell K,泰勒TN, Uehling J, Vilgalys R,白色的米,Stajich我。2016年。接合菌家谱的生活(ZyGoLife):一个phylum-level系统接合菌分类基于公司数据。Mycologia。
12. 希利RA, Zurier H,鲣鱼G史密斯,我,费斯DH。2016年。的本地和非本地块菌菌根检测历史植物园和北美的发现一个新的物种,块茎arnoldianumsp. 11月。菌根。doi 10.1007 / s00572 - 016 - 0713 - 4
13. Berch美国和鲣鱼G。2016年。松露的多样性(块茎在不列颠哥伦比亚省。菌根。doi。10.1007 / s00572 - 016 - 0695 - 2
14. 鲣鱼GHameed K Krishnan J,文图拉R, Vilgalys R . 2016。隔离功能有关公会根真菌的微生物杨树。真菌生态学。22:35-42。
15. Benucci GMN,鲣鱼G。2016年。松露微生物:细菌物种和地理位置的影响与子实体相关的地下的盘菌目。《微生物学字母。72:4-8。doi: 10.1007 / s00248 - 016 - 0755 - 3。
16. SchusterTM StajsicV,鲣鱼G。2016年。假蓼科黑穗病:第一的记录Sphacelotheca polygoni-serrulati莫雅维多利亚,澳大利亚。Muelleria。34:82 - 101。
17. Benucci GMN,勒费弗C,鲣鱼G。2016年。描述土壤真菌root-associated社区和花旗松(Pseudotsuga menziesii)站,自然产生松露(块茎oregonense&块茎gibbosum)。菌根。26日:367 - 376。doi: 10.1007 / s00572 - 015 - 0677 - 9。
18. 德国汉高TW Obase K,丈夫D, Uehling JK,鲣鱼G史密斯,艾米厘米,我。2016年。圭亚那的牛肝菌科新分类群:Binderoboletus segoi将军等sp. 11月。Guyanaporus albipodus将军等sp. 11月。Singerocomus rubriflavus将军等sp. 11月,一个新的组合Xerocomus inundabilis。Mycologia。Doi: 10.3852 / 15 - 075
19. Guevara-Guerrero G,鲣鱼G。希利,Cazares-Gonzalez E, R, Vilgalys R, Trappe j . 2015。小说块茎spp。(块菌科,盘菌目)Puberulum集团在墨西哥。子囊菌。7 (6):367 - 374。
20. Tedersoo L, Bahram M, Polme年代,Koljalg U, Yorou NS, Wijesundera R, Ruiz LV, Vasco-Palacios,星期四PQ, Suija,史密斯我,锋利的C, Saluveer E, Saitta,玫瑰花,Riit T, Ratkowsky D, Pritsch K, Poldmaa K, Piepenbring M, Phosri C,彼得森M,部分K, Partel K, ots E, Nouhra E, Njouonkou,尼尔森RH, Morgado LN,市长J,可能TW, Majuakim L,洛奇DJ,李党卫军,拉尔森KH,结束P, Hosaka K, Hiiesalu我,德国汉高TW, Harend H,郭LD, Greslebin, Grelet G, Geml J,盖茨G,邓斯坦W,扣篮C, Drenkhan R, Dearnaley J, De Kesel,见鬼T,陈X, Buegger F,布兰蕾FQ,鲣鱼GAnslan年代,Abell年代,Abarenkov K(2014)全球土壤真菌的多样性和地理。科学。346:6213。Doi: 10.1126 / science.1256688
21. 鲣鱼G纳尔逊,雷诺兹H, Hodkinson B, J, Tuskan G,罗伯逊M,斯凯特C, Vilgalys R(2014)植物宿主和土壤来源影响根际真菌和细菌组合的木本植物。分子生态学。23日:3356 - 3370。
22. Berch年代和鲣鱼G(2014)的培养即和t . aestivum加拿大不列颠哥伦比亚省(块菌科)。菌根。24:473 - 479。
23. 杨释迦M, Gottel N,卡斯特罗H, Z,甘特L,拉贝风J, Muchero W,鲣鱼GTuskan Vilgalys R, G, Podar M,斯凯特C(2013)真菌和细菌群落结构的多因素分析根系微生物的成熟摘要树。PlosONE。8 (10):e76382。doi: 10.1371 / journal.pone.0076382。
24. 史密斯我,Gryganskyi,鲣鱼G,Nouhra E, Moreno_Arroyo B, Benny G(2013)属的系统发育分析Modicella揭示了一个独立的进化起源sporocarp-forming Mortierellales真菌。真菌生物学和遗传学。doi: 10.1016 / j.fgb.2013.10.001
25. 鲣鱼G希利,史密斯M,诺瓦克M, R,格瓦拉G, Cazares E,木下光男,Nouhra E, Dominguez L, Tedersoo L, Murat C,王Y,莫雷诺B,费斯D,奈良K, Zambonelli, Trappe J, Vilgalys R(2013)历史生物地理学和多样化的松露块菌科和它的新发现妹妹血统。《公共科学图书馆•综合》。8 (1):e52765。doi: 10.1371 / journal.pone.0052765
26. Benucci GMN,鲣鱼G,Baciarelli Falini L, Donnini D, Bencivenga M(2013)菌根接种的核桃幼苗的松露。Acta Mycologica。47 (2):179 - 184。
27. 王XH Benucci GMN谢XD,鲣鱼G,刘PG Leisola M Shamekh年代(2013)形态学、菌根和分子特性的芬兰松露属于块茎anniaespecies-complex。真菌生态学。6 (4):269 - 280。
28. 希利R,史密斯我,鲣鱼G之际,费斯特DH,通用电气Z-W,格瓦拉G,威廉姆斯G,斯塔福德K, Kumar L,李T,霍巴特C, Trappe J, Vilgalys R,麦克劳克林D(2013)高多样性和广泛发生有丝分裂在真菌孢子垫盘菌目。分子生态学。22 (6)1717 - 1732。doi: 10.1111 / mec.12135
29. 格瓦拉G,鲣鱼G威廉姆斯,Trappe J, Cazares E, G,希利R,斯凯特C, Vilgalys R(2013)新的北美松露(块茎仕达屋优先计划。)和真菌协会。Mycologia。2013 105 (1):194 - 209。doi: 10.3852 / 12 - 087
30. 丈夫D,汉高T,鲣鱼G史密斯,Vilgalys V, M(2012)的新物种Xerocomus(牛肝菌目)属圭亚那盾牌,记录他们的菌根状况和果期发生。Mycologia。doi: 10.3852 / 12 - 146
31. 鲣鱼G史密斯,M, Brenneman T, Vilgalys R(2012)评估真菌真菌孢子的松露生产与核桃幼苗trap-plants土壤。植物和土壤。356:357 - 366。doi: 10.1007 / s11104 - 012 - 1127 - 5。
32. Benucci G,鲣鱼G,Baciarelli Falini L, M (2012) Mycorrhization Bencivenga核桃树(Carya illinoinensis)与商业松露物种:块茎aestivumVittad。和块茎borchiiVittad。菌根。Mycologia。22 (5):383 - 392。doi: 10.1007 / s00572 - 011 - 0413 - z
33. Tedersoo L, Abarenkov K,尼尔森H, Schuβler, GreletG,结束P, Oja J,鲣鱼G睚鲁,Veldre V, T, Ryberg M,拉尔森K, Koljalg U(2011)整理国际核苷酸序列数据库(INSD):生态、地理和序列质量注释序列的菌根真菌。《公共科学图书馆•综合》。6:e24940。
34. 鲣鱼GBrenneman T, Vilgalys R(2011)真菌真菌多样性种植山核桃果园(Carya illinoinensis;胡桃科)。菌根。21日:601 - 612。
35. 鲣鱼G,Trappe J,多诺万,Vilgalys R(2011)亚洲黑松露块茎indicum可以形成ectomycorrhizae北美宿主植物和非土壤可以完成其生命周期。真菌生态学。4:83 - 93。doi: 10.1016 / j.funeco.2010.08.003
36. 鲣鱼GBrenneman T, Vilgalys R (2011)块茎ectomycorrhizae山核桃树上(Carya illinoinensis;胡桃科)。程序从3^{理查德·道金斯}国际大会块茎。Spoleto,意大利。学报神物铺子Yunnanica增刊。十六:39-51。
37. SmithME Gryganskyi美联社、LeeSC Litvintseva美联社,鲣鱼G波特TM Anishchenko IM,海特曼J, Vilgalys R(2011)的结构、功能、和交配轨迹的发展史根霉oryzae复杂。公共科学图书馆一个。5 (12):e15273。doi: 10.1371 / journal.pone.0015273
38. 鲣鱼G,Gryganskyi Vilgalys R, Trappe J(2010)全球块茎rDNA序列:荟萃分析物种多样性、宿主特异性,和远距离传播。分子生态19日:4994 - 5008。doi: 10.1111 / j.1365 - 294 x.2010.04855.x
39. 鲣鱼G劳林森Trappe J, P, Vilgalys R(2010)主要演化支在提高分辨率块茎和分类内的物种块茎gibbosum复杂。Mycologia101 (5):1042 - 1057。
40. Trappe M, Trappe J,鲣鱼G(2010)Kalapuya brunnea将军& sp. 11月及其与其他Morchellaceae没收属的关系。Mycologia101 (5):1058 - 1065。
41. 鲣鱼GIsikhuemhen O, Vilgalys R(2010)鉴定真菌与市政堆肥使用dna技术。生物资源技术.101 (3):1021 - 1027。
42. 鲣鱼G(2009)快速dna鉴定的黑松露即使用直接PCR和物种特异性引物。《微生物学信。301 (2):171 - 175。
43. 鲣鱼GTrappe J, Vilgalys R(2009)北美的松露块菌科:分子和形态的角度。《5^th国际研讨会可食用的蘑菇菌根。楚雄,中国。Acta神物铺子Yunnanica。补充十六。
44. Schoch C, 63其他作者(2009)子囊菌类生命之树:门宽发展史澄清的起源和演化基本生殖和生态特征。系统生物学。58 (2):224 - 239。
45. 希利R,鲣鱼G格瓦拉G (2009)。Pachyphloeus marronius,一个新的松露物种从爱荷华州和墨西哥。Mycotaxon。107:61 - 71。
46. 希利R,鲣鱼G和Trappe j . (2009)Calongea,一个新的属地下的Pezizaceae。肛门del查顿Botanico马德里。66:(1)25-32。
47. 格瓦拉^,克,鲣鱼G,Cazares E,罗德里格斯J, Vilgalys R, Trappe J (2008)。一种新的来自墨西哥的黑松露,块茎regimontanum。墨西哥真菌学》杂志上。26:17-20。
48. Iotti M, Amicucci,鲣鱼G,Bonuso E, Stocchi V, Zambonelli (2007)。选择一组特定的引物的识别块茎rufum:松露与高遗传变异物种。《微生物学字母。277 (2):223 - 231。
49. 柯林斯SL,贝当古LMA, Hagberg Larkey L,棕色的射频,摩尔DI,鲣鱼G利林KA,杰克逊SP,约翰逊DW,伯利SC,伍德罗·RR McAuley JM。(2006)使用无线传感器网络的生态遥感的新机会。生态与环境前沿。4:402 - 407。
50. 鲣鱼、通用、科尔曼特区。,Haines, B.L. and Cabrera, M.L. (2003). Can nitrogen budgets explain differences in soil nitrogen mineralization rates between oak pine and northern hardwood stands?森林生态与管理。276 (1):563 - 574。

书:

1. Zambonelli A和鲣鱼G(Eds) (2013)食用真菌蘑菇:当前的知识和未来前景。土壤生物学系列:34。不可靠的人。

同行评审报告和书的章节:

1. 赖特C, Gryganskyi,鲣鱼G。2016年。真菌和堆肥。:真菌应用于可持续的环境生物技术。艾德。黛安娜购买。真菌生物学系列:34。不可靠的人。
2. 鲣鱼G我和史密斯。2016年。General systematic position of the truffles: Evolutionary theories.在。真正的松露(块茎spp。)世界:土壤生态学、分类学和生物化学。不可靠的人。Eds。Zambonelli, Iotti M, Murat C。
3. 希利R,鲣鱼G史密斯,我。2016年。简要概述的分类学、分类和生态的块茎rufum进化枝。在。真正的松露(块茎spp。)世界:土壤生态学、分类学和生物化学。不可靠的人。Eds。Zambonelli, Iotti M, Murat C。
4. Payen T, Murat C,鲣鱼G。2014年。松露phylogenomics:松露的新见解进化和生命周期。真菌。(Ed)弗朗西斯·马丁。爱思唯尔。
5. 马丁F和鲣鱼G。2013年。十年的真菌真菌基因组学:我们,我们应该走哪边呢?在:食用真菌蘑菇:当前的知识和未来前景。(Eds) a Zambonelli和g鲣鱼。土壤生物学系列:34。不可靠的人。
6. 史密斯M和鲣鱼G。2013年。分类学和生态学的真菌蘑菇。在:食用真菌蘑菇:当前的知识和未来前景。(Eds) a Zambonelli和g鲣鱼。土壤生物学系列:34。不可靠的人。
7. Benucci GN,鲣鱼G,Donnini D, Baciarelli Falini L, Di马西莫·G, Bencivenga m . 2013。松露、木材、食品和燃料:可能性在耕地复种块菌经济重要的植物。在:食用真菌蘑菇:当前的知识和未来前景。(Eds) a Zambonelli和g鲣鱼。土壤生物学系列:34。不可靠的人。
8. Pregenzer A Parmenter RR Passell H, Vande城堡J,让步T,鲣鱼g . 2004。在干旱草原可持续发展:新技术应用管理。在:生物多样性在旱地。牛津大学出版社。
9. 埃斯特林D,麦切纳W,鲣鱼G研讨会的参与者。2003年。分布式传感器网络环境的计算机需求:从国家科学基金会赞助的研讨会报告。斯克里普斯海洋研究所的拉霍亚,CA。2003年8月12 - 14。http://lternet.edu/sensor_report/cyberRforWeb.pdf
10. 休斯Nagel D, D和鲣鱼G。2003年。环境传感器网络。:在任何地方任何信号,任何规模:跨部门危机管理财团——会议论文集。弗吉尼亚州阿灵顿1月11 - 13日,2002年。
11. 鲣鱼G和Michner w . 2002。现场环境传感器技术亮点。:《2002年全国环境科学与技术会议。北卡罗来纳州格林斯博罗,2002年9月8 - 10日。伯特立出版社。pp.185 - 194。
12. Goodin D和鲣鱼G。2002年。原位传感器。在会议记录:可伸缩的信息网络环境。2001年圣地亚哥超级计算机中心10月29日到31日。

发明披露:

1. Weisenberger,鲣鱼G史密斯,里德C, m . 2015。方法和仪器生物相互作用在植物形象。发明披露# 1343
2. Vilgaly R,鲣鱼G。Hameed K, Lipkowitz J,斯凯特c . 2014。植物生长促进真菌。发明披露# 4331

非同行评议的出版物:

1. Grupe AC, Brenneman T,鲣鱼G史密斯,我。(2016)山核桃松露(块茎lyonii):美食产于美国东南部的松露。(edi PP330)。佛罗里达大学盖恩斯维尔:食品和农业科学研究所。http://edis.ifas.ufl.edu/pp330。
2. 鲣鱼G,Hallan H,沃尔克T,亚当斯G(2016)可能是莫雷尔月在密歇根州。密歇根州立大学公报E2755延伸。
3. 鲣鱼G,Benucci GMN,山J, Cregg B(2016)蘑菇和松露密歇根圣诞树行业特色作物种质资源。圣诞树。
4. Sharma J,史密斯Trela B,王,M,鲣鱼G(2012)山核桃松露(块茎lyonii)在德克萨斯州。山核桃南杂志。秋天:19到24。
5. 史密斯,鲣鱼GSharma J,长J, B, Brenneman T(2012)山核桃松露(块茎lyonii):我们知道什么,我们需要知道。佐治亚州山核桃杂志。春天:52-59。
6. Le顶端F,王YW, Jeandroz年代,鲣鱼GMurat C (2009) Phylogenie et des truffes paleogeographie。法国'horticulture et d国立de l 'Herault。
7. 鲣鱼G、Vilgalys R Isikhuemhen O(2008)第二届松露生物技术研讨会。培养液。59 (5)。
8. 鲣鱼G和Casarez E(2007)看样子,南部的边界。培养液。58:(32)。
9. 麦切纳W和鲣鱼G(2003)Ecoinformatics培训领域。lte网络通讯(1):10。
10. 鲣鱼G(2001)一个现场环境传感器资源-网站:http://lternet.edu/technology/sensors/index.html
11. 鲣鱼G戴维斯,波特D, D (2001)简介:蘑菇和真菌在乔治亚州植物园,雅典,GA。