帕特里克磨边机他是密歇根州立大学的助理教授BOB体育)园艺系该校获得了一项为期四年、价值113万美元的资助，其中包括相应的资金美国农业部(USDA)bob体育合法吗改善蓝莓和蔓越莓果实品质性状。

埃杰的实验室正在努力为该属生成第一个泛基因组，即一个物种中存在的一整套基因Vaccinium它由灌木种类组成，包括那些生长蓝莓和蔓越莓的灌木。这一项目被称为Vaccinium协调农业项目(VacCAP)，将有助于指导未来蓝莓和蔓越莓的育种工作，并包括一个由美国各地大学和美国农业部合作伙伴组成的合作网络

埃杰说:“我们的目标是发现与优质水果品质相关的基因。”

基因分析

和博士生一起艾伦Yocca埃杰正在为24个蓝莓品种(即栽培植物品种)和12个蔓越莓品种生成基因组。这些基因组将有助于揭示这两种重要作物的现有遗传多样性。

与单个基因组不同，泛基因组能够捕获一个物种内存在的所有遗传多样性。埃杰估计，至少30%的基因可能存在或不存在，这取决于栽培品种。

埃杰说:“如果我们把所有的分析都建立在一个基因组上，我们就会漏掉很多基因。”“在基础研究层面上，我们真正感兴趣的bob体育登录是更好地了解基因组是如何进化的，以及是什么机制导致了一个物种中所观察到的基因含量变化。”

构建一个泛基因组需要大量的计算资源。埃杰正在和密歇根州立大学网络研究所，bob体育登录这为研究人员提供了获得高性能技bob体育登录术的途径，以满足这些需求。

“我们很高兴网络研究所将通过解决计算和数据存储需求，为VacCAP项目做出贡献，”他说bob体育登录布莱恩·奥谢， ICER主任。

埃杰和尤卡希望通过构建泛基因组，找到新的基因，最终培育出更结实、更美味、更芳香的蓝莓。

埃杰说:“这项拨款的目的是建立一个路线图。”“如果我们的目标是提高硬度和整体水果质量，那么哪些基因和基因变异是重要的?”

行业的影响

坚硬的果实更容易用机器收割，机器收割可以帮助蓝莓种植者提高利润率。

埃杰说:“采摘水果的劳动力非常稀缺。“对于种植者来说，如果可以用机器收割水果，就不必雇人采摘了，这就增加了他们的盈利能力。”

人工采收的人工成本占蓝莓生产成本的一半以上。

在计划这个项目时，埃杰和约卡对全国500多名蓝莓种植者、育种者、加工商和其他蓝莓行业人士进行了调查。机器收获能力是美国所有地区的首要任务

埃杰说:“培育新品种，推动整个行业向前发展，真是令人兴奋和有益的。”“这是一个非常重要的优先事项，我期待着帮助密歇根州的蓝莓产业。”

密歇根州的蓝莓产量通常排在全国前五名。

他说:“多年来，我们一直在为加工市场进行机械收获，但如果蓝莓丛成熟得更均匀、更结实，无疑更适合机器收获。凯文·罗布森，执行董事密歇根州蓝莓委员会．“我们期待着看到这个研究项目的结果，以及它将如何帮助密歇根州的蓝莓产业更具可持续性。”bob体育登录

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